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由于沒有具體的技術規范可以參考，藥廠質檢中心實驗室設計要根據我國現行GMP和《藥品檢驗所實驗室質量管理規范(試行)》有關實驗室的相關要求，結合自己的認識、理解并在實際工作中進行總結，從而得到符合實際需要又滿足規范的科學可行的設計。

主要功能間的設置

藥廠的質檢中心既是獨立于生產的一個質量管理部門，又與生產部門緊密相關，負責著藥品生產全過程的質量控制和檢驗。它的機構設置組成如下：

質量管理部門

質量保證(QA)
   質量控制(QC)：中心檢驗室（理化分析檢驗、生物分析檢驗）、車間化驗室
  藥廠質檢中心承擔著質量管理部門的一個重要職能一質量控制。其中的質量控制室又分為車間化驗室和中心檢驗室。車間化驗室的設置主要是為生產過程服務的，負責按生產過程工藝控制指標要求以及對半成品(中間體)進行分析榆驗。它通常都設置在藥品生產廠房內。質檢中心的中心檢驗室由兩個單元組成：即理化分析檢驗(儀器分析和化學分析)和生物分析檢驗(微生物學檢驗)。理化分析檢驗是對所收到的原料、包裝材料、原料藥中間體和成品等進行理化鑒別、含量測定和其它檢驗，以保證其質量符合法定要求和藥品質量標準要求；生物分析檢驗則通過一系列微生物學檢驗試驗以鑒定原料、包裝材料、原料藥中間體和成品的微生物污染情況。對某些產品如：無菌制劑，則還要做專門的無菌檢驗以及生產環境的微生物狀況檢查。

歸納總結起來，藥廠質檢中心具體功能間的設置：
(1)試劑、標準品室；
(2)清潔洗滌區，如清潔室、消毒室、準備室、培養室；
(3)一般分析實驗區，如化學實驗室、包材檢驗室、原輔料檢驗室、成品檢驗室、普通儀器窒；
(4)資料存儲、數據處理區，如檔案資料室、電腦室；
(5)留樣觀察室，包括加速穩定性考察室；
(6)人員用室，如：更衣室、休息室；
(7)特殊分析作業區。分為理化系統(如高溫室、天平室、精密儀器室、毒氣室等)和生物系統(如微生物限度檢定室、抗生素微生物檢定室、無菌檢查室等)。另外，還應設有辦公室、中藥標本室(對中藥制劑)。

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