目前，確定合理的冷熱源供給方式、功能區域詳細劃分、分時段、分系統設計全面、局部通風量，盡量降低換氣次數，設備冷熱量回收等是實驗動物屏障設施節能的關鍵，也是體現設計機構技術水平的標志。
因此，實驗動物屏障設施的節能措施有以下幾個重點：
確定合理的冷熱源供給方式
實驗動物屏障設施為了維持實驗動物次級環境的最適溫、濕度，選定合理的冷熱源極為重要。
臨床醫療機構一般供應室配備有數臺滅菌設備，使用燃氣鍋爐為熱源，因此，實驗動物屏障設施以燃氣鍋爐作為供熱源為首選。冷源可根據系統劃分與設備節能特點選定。也可以采用地源、水源熱泵機組，制冷制熱工況穩定，能效比高，節能效果顯著。
功能區域詳細劃分，降低空調冷熱負荷
實驗動物屏障設施應根據使用特點詳細劃分各功能區域，凈化空調系統新風的熱濕和凈化處理可集中也可分散設置。
負壓區劃分以可能對動物構成污染或產生污染臭氣的無潔凈度要求的區域（生物安全類實驗室ABSL-2以上除外）。如：籠器具清洗消毒區、普通級大動物飼育區、對外緩沖區、滅菌前區、電梯前廳等，宜設計單獨（-10Pa）負壓區。
正壓區劃分依據國家標準，按照壓力梯度劃分為動物生存區和輔助區、通道區等。
次級環境的設備通風：在潔凈區內相對于潔凈室設計負壓的管道系統。主要指與動物飼養設備密接的專門負壓系統。如IVC、EVC、隔離器、換籠臺、生物安全柜、轉運推車、潔凈工作臺等設備運行過程中，產生污染氣溶膠，威脅潔凈區動物，該類設備排風接入初級環境排風系統支管，又對其造成影響。因此不應向室內排風，也不應接入初級環境排風支管。
分時段設計：24小時運行和間斷運行的部分要區分開來；根據動物生存區動物數量調整換氣次數，宜采用變頻方式。動物生存區內采用換氣效率高的送風口及氣流控制方式，以及部分排風再循環，減少新風使用量。
采用先進技術，充分回收能量
根據采用顯熱能量回收裝置，在寒冷及嚴寒地區冬季大溫差工況下，顯熱回收率50-60，節能效果較為顯著。國外已有實驗動物設施采用分子篩式全熱能量回收裝置，全熱回收效率70%以上，節能效果顯著。總排風管經無害化處理后可以全部排風再循環，減少新風使用量。
圍護結構保溫
強化外墻與屋面的隔熱保溫能力：根據實驗目的、動物種類和房間功能的不同進行分區。
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