主要功能間環境凈化級別的設置
質檢中心作為藥廠的輔助設施，它也和GMP生產車間一樣，“麻雀雖小，五臟俱全”，因此針對不同的功能問也應有不同的環境參數要求。藥廠質檢中心環境參數的設置要求分為三類：
第一類是對功能間有溫、濕度要求的；指加速穩定性考察室、天平室、精密儀器室等。如加速穩定性考察室的環境參數通常為：溫度40℃，濕度75％；對天平室、精密儀器室主要是要求除濕。
第二類是對功能間沒有特殊要求，只需要普通通風的；是指一般分析實驗區、辦公室等；毒氣室則要求有專用的排氣設施；其他房間則只要普通通風就行。
第三類是對功能間有空氣潔凈度要求的。指無菌檢查室、微生物限度槍定室和抗生素微生物檢定室等，設計中可按以下原則設置：
(1)無菌檢查室、微生物限度檢查室和抗生素微生物檢定室，應分開設置；
(2)無菌檢查室、微牛物限度檢定室應為無菌潔凈室，室內凈化級別不應低于l萬級，操作區應設置局部100級單向流裝置；
(3)對抗生素微生物檢定室，其凈化級別至少應為10萬級。
空氣凈化系統及輔助設施的設置
對有凈化級別要求的無菌檢查室、微生物限度檢定室和抗生素微牛物檢定室等功能間，為實現其空氣潔凈度的控制要求，必須對室外空氣進行凈化處理。為避免藥廠質檢中心的空氣凈化系統與藥品生產區發生交叉污染，其空氣凈化系統應與生產區嚴格分開。
需要指出的是，造成檢品污染和交叉污染的主要原因來自操作環境中的微粒(灰塵、藥塵等)和微生物。它們寄跡于操作人員、空氣、工藝用水、原輔物料、設備設施等各種載體，并直接或間接地污染檢品。因此，質檢中心除應對有凈化級別要求的功能間采取相應的空氣凈化措施以滿足其空氣潔凈度要求外，還應對進入這些功能問的人員、物料、設備或設施等進行全面凈化，各自設置相應的人凈、物凈及消毒設施，只有這樣，才能做到真正意義上的防止交叉污染。
人凈設施
在藥品生產過程的眾多污染源中，人是潔凈室中最大的污染源。一是人在新陳代謝過程中會釋放或分泌污染物；二是人體表面、衣服能沾染、粘附和攜帶污染物；三是人在潔凈室內的各種動作會產生大量微粒和微生物。要確保操作環境所需要的空氣潔凈度等級，就必須對進入潔凈區的人員進行更衣，目的是為了防止由于人的因素使室內空氣含塵、含菌量增加，最大限度地阻留人體脫落物。需要指出的是為避免交叉污染，進入質檢中心1萬級無菌室、1萬級非無菌室和10萬級潔凈室的人員凈化設施應分別設置，不能互相串用和混用。即使操作者是同一個人，也應按進入不同潔凈室的程序重新更衣。人凈設施有：更衣間、洗手間、消毒間和緩沖間及其相關設施組成。
物凈設施
物凈又分物料的凈化和設備或設施的凈化。物料凈化是指對生產、操作所用的原輔物料、試劑、半成品、包裝材料等的凈化；設備或沒施的凈化是指對設備、檢驗用水、管路及配件、工器具等的凈化。進入無菌室的物品和物凈設施應按無菌要求處理和設置，物凈設施有：傳遞窗(帶紫外線殺菌)、外清間、消毒間、緩沖間、工器具清洗間等相關設施。
醫藥工程設計人員承擔的藥廠工程設計中，涉及到：抗生素類西藥、中藥類；劑型有：注射劑（無菌和非無菌）、口服固體制劑等。專業人員應對國內外GMP及國家相關相關規范做到深刻理解并融會貫通。
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