一、空氣流和壓差要求
1、PCR實驗室的空氣流向必須嚴格按照試劑儲存和準備區→標本制備區→擴增區→擴增產物分析區空氣壓力逐漸遞減方式進行，防止擴增產物順空氣氣流進入擴增前的區域。2、空氣潔凈級別不同的相鄰房間之間的靜壓差應大于5帕，潔凈室(區)與室外大氣的靜壓差應大于10帕，應配備監測靜壓差的設備，并定期監控。通過控制進風風量與排風風量達到壓力效果。 一般情況下，試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓，以防外界含核酸氣溶膠的空氣進入造成污染;核酸擴增室及產物分析室應呈微負壓，以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品;PCR實驗室緩沖間內，可設置正壓，使室內空氣不流向室外，室外空氣不流向室內。
二、潔凈裝修要求
1、潔凈室(區)的內表面應平整光滑、無裂縫、接口嚴密、無顆粒物脫落，并能耐受清洗和消毒，墻壁與地面的交界處宜成弧形或采取其他措施，以減少灰塵積聚和便于清潔。
2、潔凈室(區)內各種管道、燈具、風口以及其他公用設施，在設計和安裝時應考慮使用中避免出現不易清潔的部位
3、潔凈室(區)的窗戶、天棚及進入室內的管道、風口、燈具與墻壁或天棚的連接部位均應密封。
三、工作服要求
1、進入各個區域必須嚴格按照單一方向進行，不同的工作區域使用不同的工作服(例如不同的顏色)。工作人員離開時，不得將工作服帶出。2、各工作區域內配置專用的工作服和工作鞋，工作服要求不同顏色，工作鞋要求包裹整個腳面，并且在工作服和工作鞋上標記工作區域名稱。
四、人流路徑與物流路徑
進入實驗室區域工作人員應該按照以下路徑:公共清潔區--更衣間(更換潔凈服)--緩沖間--污染實驗區
工作人員退出實驗室的路徑為：污染試驗區--緩沖間--淋浴間(有條件的可設置)--更衣間--公共清潔區
所有的物品進入實驗區必須經過傳遞窗，利用傳遞窗消毒后才可進入，實驗室內所有物品的也必須經過傳遞窗才可以傳遞到其他實驗區。
五、門的開啟方向
1、一般實驗室門主要向里開，但如有危險的房間，房門應朝外開；
2、有壓差梯度的房間，門的開啟方向應朝向正壓方向一側開啟;
3、考慮到消防安全，對于那些主要逃生門的開啟方向應朝向清潔區方向開啟。
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