核酸檢測實驗室建設條件和流程分析，通常醫院檢驗科和病理科等科室使用的實驗室為生物安全二級（BSL-2）實驗室。但新冠病毒核酸檢測用PCR實驗室則不同，《醫療機構發熱門診臨床實驗室能力建設專家共識（2020 版）》說明：對于用于新冠病毒檢測的PCR實驗室（以下簡稱“PCR實驗室”）選址宜設置在發熱門診內，且建筑標準宜滿足加強型醫學BSL-2實驗室標準。
1、PCR實驗室應合理選址和布局
《醫療機構發熱門診臨床實驗室能力建設專家共識（2020 版）》要求，對于用于新冠病毒檢測的PCR實驗室應設置在檢驗科中心實驗室和急診實驗室以外的區域，宜在發熱門診區域內，同時，應自成一區，宜設置在建筑的一端。
實驗室防護區應包括主實驗室、緩沖間、防護服更換間等，輔助工作區應包括清潔衣物更換間、淋浴間等。
PCR實驗室平面布局一般可分為 “四區”，即試劑準備區、樣本制備區、核酸擴增區和產物分析區。結合實際，可采用集中布置或分散布置形式，并配套設置洗消設施。
當采用實時熒光定量PCR儀時，核酸擴增區和產物分析區可合并為一區。當采用一體化自動化核酸分析設備時，樣本制備區、核酸擴增區和產物分析區可合并為一區。
《新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術指南（第四版）》指出，新冠病毒核酸檢測方法主要是實時熒光RT-PCR方法，所以用于新冠病毒檢測的PCR實驗室可以設置為 “三區”。
2、PCR實驗室應合理規劃檢驗人員
PCR實驗室標本制備室的生物安全要求最高，檢驗人員進入該區域緩沖間前需要在更衣室穿防護服，實驗結束后在緩沖間脫掉防護服，因此需要設置更衣室和合理規劃進出實驗室動線。
為提高效率，咽拭子標本宜設置可直接進入標本制備室的運輸動線，同時標本傳遞口應設置傳遞窗。
根據《新型冠狀病毒感染的肺炎疫情醫療廢物應急處置管理與技術指南（試行）》要求，有條件的醫療衛生機構可對肺炎疫情防治過程產生的感染性醫療廢物的暫時貯存場所實行專場存放、專人管理，不與其他醫療廢物和生活垃圾混放、混裝。
因此，針對標本制備室高壓滅菌消毒后的污物，應規劃污物運輸動線和相對獨立的暫存間。
3、PCR實驗室氣流組織應符合定向氣流原則
氣流組織應有利于室內氣流由被污染風險低的空間向被污染風險高的空間流動，最大限度減少室內回流與渦流。通風空調系統應保證各工作區的空氣不產生交叉污染。
實驗室的空氣流向可按照試劑儲存和準備區→標本制備區→擴增區→擴增產物分析區進行，防止擴增產物順空氣氣流進入擴增前的區域。
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