植物細胞培養是在嚴格無菌的條件下進行的，在設計細胞培養實驗室時，應按培養程序來沒計，避免某些環節倒排，引起日后工作混亂。要做到無菌的條件，需要一定的設備、器材和用具，同時還需要人工控制溫度、光照、濕度等培養條件。
植物細胞培養實驗室設計原則：保證無菌操作，達到工作方便，防止污染。
植物細胞培養實驗室組成：1、化學實驗室 2、洗滌菌室 3、無菌操作室（接種室）4、培養室 5、細胞學實驗室6、其他小型儀器設備。
1) 化學實驗室（準備室）：完成所使用的各種藥品的貯備、稱量、溶解、配制、培養基分裝等。
2）洗滌、滅菌室：完成各種器具的洗滌、干燥、保存、培養基的滅菌等。
3) 無菌操作室（接種室）：主要用于植物材料的消毒、接種、培養物的轉移、試管苗的繼代、原生質體的制備以及一切需要進行無菌操作的技術程序。
接種室宜小不宜大，一般7～8平米，要求地面、天花板及四壁盡可能密閉光滑，易于清潔和消毒。配置拉動門，以減少開關門時的空氣擾動。接種室要求干爽安靜，清潔明亮。在適當位置吊裝1～2盞紫外線滅菌燈，用以照射滅菌。安裝一小型空調，使室溫可控，這樣可使門窗緊閉，減少與外界空氣對流。接種室應設有更衣室和緩沖間并安裝紫外滅菌燈，進入無菌操作室前在此更衣換鞋，以減少進出時帶入接種室雜菌。
4) 培養室：培養室是將接種的材料進行培養生長的場所。培養室的大小可根據需要培養架的大小、數目、及其他附屬設備而定。其設計以充分利用空間和節省能源為原則。高度比培養架略高為宜，周圍墻壁要求有絕熱防火的性能。
培養室最重要的因素是溫度，一般保持在20—27℃左右，具備產熱裝置，并安裝窗式或立式空調機。由于熱帶植物和寒帶植物等不同種類要求不同溫度，最好不同種類有不同的培養室。
室內濕度也要求恒定，相對濕度以保持在70%～80%為好，可安裝加濕器。控制光照時間可安裝定時開關鐘，一般需要每天光照10-16h，也有的需要連續照明。短日照植物需要短日照條件，長日照植物需要長日照條件。
5) 細胞學實驗室：用于對培養物的觀察分析與培養物的計數等。
6) 其他小型儀器設備：分注器、血球計數器、移液槍、過濾滅菌器、電爐等加熱器具、磁力攪拌器、低速臺式離心機等。
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